broadinstitute/gatk 软件分析报告

基础信息

项目名称:broadinstitute/gatk

项目徽章:

Security Status

仓库地址:https://github.com/pterodactyl/panel

检测报告地址:https://www.murphysec.com/console/report/1716471658537680896/1716471658596401152

此报告由Murphysec提供

漏洞列表

漏洞名称 漏洞类型 MPS编号 CVE编号 漏洞等级
Apache Commons Beanutils 存在不可信数据的反序列化漏洞 反序列化 MPS-2019-10233 CVE-2019-10086 高危
Apache HttpClient URI解析错误漏洞 XSS MPS-2020-17341 CVE-2020-13956 中危
Apache Commons Configuration 存在 RCE 漏洞 代码注入 MPS-2020-3836 CVE-2020-1953 严重
Apache Commons IO 存在路径遍历漏洞 路径遍历 MPS-2021-4531 CVE-2021-29425 中危
org.ojalgo:ojalgo 存在密码学问题漏洞 密码学问题 MPS-2022-11904 中危
Apache Commons Configuration 任意代码执行漏洞 表达式语言注入 MPS-2022-19214 CVE-2022-33980 中危
Python 安全漏洞 ReDoS MPS-2022-57238 CVE-2022-40897 中危
SQLite JDBC 远程代码执行漏洞 代码注入 MPS-zprx-hdwf CVE-2023-32697 高危

缺陷组件

组件名称 版本 最小修复版本 依赖关系 修复建议
commons-beanutils:commons-beanutils 1.9.3 1.9.4 直接依赖 建议修复
org.apache.commons:commons-configuration2 2.4 2.8 直接依赖 建议修复
org.xerial:sqlite-jdbc 3.36.0.3 3.41.2.2 直接依赖 建议修复
commons-io:commons-io 2.5 2.7 直接依赖 可选修复
setuptools 39.2.0 65.5.1 间接依赖 可选修复
org.ojalgo:ojalgo 44.0.0 48.3.2 直接依赖 可选修复
org.apache.httpcomponents:httpclient 4.5.12 4.5.13 直接依赖 可选修复

许可证风险

许可证类型 相关组件 许可证风险
Apache-2.0 15
BSD-3-Clause 5
自定义许可证 8
WTFPL 1
MIT 1

SBOM清单

组件名称 组件版本 是否直接依赖 仓库
CallerUpdateSummary 间接依赖 pip
org.apache.commons:commons-vfs2 2.0 直接依赖 maven
pymc3 间接依赖 pip
org.broadinstitute:hdf5-java-bindings 1.1.0-hdf5_2.11.0 直接依赖 maven
SampleReadDepthMetadata 间接依赖 pip
HybridInferenceParameters 间接依赖 pip
commons-beanutils:commons-beanutils 1.9.3 直接依赖 maven
org.apache.httpcomponents:httpclient 4.5.12 直接依赖 maven
org.jgrapht:jgrapht-io 1.1.0 直接依赖 maven
libgomp.so.1 间接依赖
header 间接依赖 pip
libm.so.6 间接依赖
org.broadinstitute:gatk-native-bindings 1.0.0 直接依赖 maven
org.reflections:reflections 0.9.10 直接依赖 maven
Any 间接依赖 pip
Caller 间接依赖 pip
com.opencsv:opencsv 3.4 直接依赖 maven
org.apache.commons:commons-configuration2 2.4 直接依赖 maven
libc.so.6 间接依赖
com.google.cloud.bigdataoss:gcs-connector 1.9.4-hadoop3 直接依赖 maven
List 间接依赖 pip
Optional 间接依赖 pip
setuptools 39.2.0 间接依赖 pip
load_model 间接依赖 pip
org.bdgenomics.bdg-formats:bdg-formats 0.5.0 直接依赖 maven
Set 间接依赖 pip
org.ojalgo:ojalgo 44.0.0 直接依赖 maven
org.broadinstitute:http-nio 0.1.0-rc1 直接依赖 maven
Deque 间接依赖 pip
org.apache.commons:commons-collections4 4.1 直接依赖 maven
Dict 间接依赖 pip
gov.nist.math.jama:gov.nist.math.jama 1.1.1 直接依赖 maven
org.hipparchus:hipparchus-stat 2.0 直接依赖 maven
Tuple 间接依赖 pip
org.aeonbits.owner:owner 1.0.9 直接依赖 maven
Callable 间接依赖 pip
/usr/lib/libc++.1.dylib 间接依赖
HybridInferenceTask 间接依赖 pip
SamplePloidyMetadata 间接依赖 pip
org.apache.commons:commons-math3 3.5 直接依赖 maven
org.xerial:sqlite-jdbc 3.36.0.3 直接依赖 maven
Model 间接依赖 pip
libpthread.so.0 间接依赖
/usr/lib/libSystem.B.dylib 间接依赖
commons-io:commons-io 2.5 直接依赖 maven
config 间接依赖 pip
org.apache.commons:commons-lang3 3.5 直接依赖 maven
org.broadinstitute:gatk-bwamem-jni 1.0.4 直接依赖 maven
org.broadinstitute:gatk-fermilite-jni 1.2.0 直接依赖 maven
org.jgrapht:jgrapht-core 1.1.0 直接依赖 maven
com.thoughtworks.paranamer:paranamer 2.8 直接依赖 maven
Generator 间接依赖 pip
libgcc_s.so.1 间接依赖
it.unimi.dsi:fastutil 7.0.6 直接依赖 maven
Sampler 间接依赖 pip
libstdc++.so.6 间接依赖
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